1318年に即位した後醍醐天皇は、院政・摂政・関白を廃して天皇みずからが政治を行う「天皇親政」を志します。建武の新政（のちの倒幕後）の布石となる積極的な政治姿勢は、幕府にとって危険な存在となります。

再び倒幕計画が発覚した後醍醐天皇は笠置山（京都府）に逃れ籠城。幕府軍の攻撃で落城し、天皇は捕らえられ隠岐に流されます。しかし倒幕の炎は消えませんでした。

河内（大阪）の武士・楠木正成は赤坂城・千早城に籠り、大軍の幕府軍を相手に巧みなゲリラ戦で抵抗を続けます。正成の粘り強い戦いが全国の倒幕派を鼓舞し、足利尊氏・新田義貞を動かすきっかけとなりました。

後醍醐天皇が隠岐を脱出し倒幕の旗を掲げると、幕府の有力武将・足利尊氏が六波羅探題を攻撃して離反。同じ頃、新田義貞が関東で挙兵し鎌倉に攻め込みます。北条高時ら北条一族は東勝寺で自刃し、鎌倉幕府148年の歴史に幕が下ります。