コメントありがとうございます！
まず「朝廷は『源信が犯人だ』という密告を受け・・・」の部分ですが、ご指摘のとおり右大臣に密告が正しい表現です。記事についても修正をしました。
当時の命令系統についてはすみませんが私も正確な部分は把握しておりません・・・。記事中では伴善男が藤原良相に密告を行い、それを受け藤原良相が兵を派遣したという文脈で書いています。藤原良相は右大臣であるとともに左近衛府という天皇護衛部隊の長官でもあったようです。つまり、自らの率いる部隊であれば藤原良相の権限で兵を派遣することも可能だっということです。自ら率いる部隊だけを派遣しているので、兵と言ってもおそらく少数だったであろうと思います。

あまり断言的な回答をできず申し訳ありませんが、以上が私の可能な範囲での回答です。本当は回答のソースを示せれば良いのですが、やはりなかなか難しいです・・・。